慢性结肠炎是指直肠结肠因各种致病原因导致肠道的炎性水肿、溃疡、出血病变。通常根据慢性结肠炎致病原因分为特异性，即有明显原因的结肠炎，和非特异性即致病原因不明的结肠炎。特异性结肠炎常见的有痢疾、结肠结核、阿米巴痢疾、放射性直肠炎等，非特异性结肠炎有溃疡性结肠炎、克隆氏病等。而临床所称的慢性结肠炎多指非特异性的。

慢性结肠炎必须通过内窥镜检查才能明确炎症的不同范围和病变的程度，从而明确诊断。

通过病理检查和连续定期的内窥镜追踪检查后，不断调整治疗方案，才能使结肠炎得到合理的有效治疗。所以慢性结肠炎的诊断较为复杂，常常要进行反复排除性检查才能正确诊断。慢性结肠炎的诊断包括临床类型、严重程度、病变范围及病程的阶段。结肠炎明确的诊断对正确的治疗意义重大。