引起慢性肠炎的原因有很多 主要有以下几种：

　　1.病菌感染引起：病菌的感染是慢性肠炎发病的主要原因之一。细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物，在随着食物和水进入人体后，就会刺激肠道黏膜，久而久之就会形成慢性肠炎。

　　2.过敏反应引起：过敏反应性传播疾病变，受个体差异影响。主要是肠道性过敏反应，也时有累及皮肤。有些人对鱼类、虾、蟹、牛乳等高蛋白食物产生过敏反应，这些都是异体蛋白进入人体时所产生大量组织胺物质，引发过敏性反应。

　　3.自身免疫：随着社会进展，医学的进步，免疫学的迅速成长，有很多不明发病的主因的都已探明。眼前，免疫疾病的发作率高，治疗难度大，患者应引起重视。

　　4.急性肠炎的遗患：如果急性肠炎没有彻底治好，在某些因素的刺激，也会慢慢发展成慢性肠炎。

　　慢性肠炎对人体的危害不仅仅局限于一些症状表现，如果不及时治疗，可引发肠结核、胃肠神经官能症甚至是溃疡性结肠炎等严重疾病，希望患者们能够引起重视。